En una misión arqueológica al final del universo conocido, el profesor Daiba desata sin querer un antiguo horror de su confinamiento. Cinco años después, la malevolente fuerza alienígena pone en marcha un plan que reúne a los diversos miembros de la tripulación de la Arcadia para navegar por las estrellas una vez más, así como para llevar a Tadashi Daiba a encontrarse con Harlock por primera vez (de nuevo).
