La boda de Goemon con Murasaki Inabe, hija del líder de un clan samurái, es interrumpida cuando los ninjas Fuma atacan, secuestrando a la novia y exigiendo el antiguo tesoro de su familia como rescate. Lupin, Jigen, Goemon y Fujiko trabajan juntos una vez más para intentar salvar a Murasaki y llegar al tesoro antes de que los Fuma puedan robárselo.
