Golpeado y dejado a morir, Ryuunosuke Ibuki es despojado de todo lo que le pertenece. Al verlo en tal estado lamentable, un hombre llamado Kamo Serizawa le da una segunda oportunidad y le ofrece convertirse en su asistente personal. Ibuki parece ser salvado del dolor, pero este nuevo estilo de vida solo lo convierte en un perro para uno de los hombres más influyentes de todo Kyoto. Mientras tanto, con el aumento de los ataques de ronin a la población en general, el shogunato envÃa a los Roshigumi a Kyoto para luchar por la paz. Liderado por el honorable, aunque modesto, Isami Kondou, el Roshigumi está compuesto por fuertes y hábiles samuráis, pero carece de conexiones polÃticas significativas para ganar terreno en una ciudad asolada por el crimen. Sin otra opción, Kondou se alÃa con el arrogante Serizawa y sus contactos a cambio de su fuerza combativa. A pesar de odiar todo lo que los samuráis representan, Ibuki se encuentra atrapado en los asuntos del Roshigumi. Sin embargo, a medida que interactúa con los miembros bajo el liderazgo de Kondou, Ibuki lentamente se da cuenta de que no todos los samuráis son tan crueles y deshonrosos como él pensaba. Hakuouki Reimeiroku explora los primeros dÃas que conducen a la formación del Shinsengumi, mientras la tensión polÃtica en Kyoto da lugar a la inestabilidad y la incertidumbre.
